色譜法的分離原理是溶于流動相（phase）中的各組分經過固定相時，由于與固定相（stationaryphase）發生作用（吸附、分配、離子吸引、排阻、親和）的大小、強弱不同，在固定相中滯留時間不同，從而先后從固定相中流出的分離過程，其實質是一個吸附與解吸附的平衡過程。
　　
　　色譜柱與流動相的溫度，影響著組分的分離平衡，對于使用柱溫箱的有益之處我們認為有以下幾點：
　　
　　1.可以使保留時間相對恒定，對需要進行的定性鑒別可提高其可信
　　
　　度；
　　
　　2.保留時間相對恒定是進行定量的基礎，不同的保留時間不僅不能
　　
　　判斷其成份的一致性，同時，由于保留時間不同峰面積也必將發
　　
　　生變化，其檢測結果的可信度將受質疑。
　　
　　3.溫差較大時，因保留時間不穩將增加檢測工作的麻煩。
　　
　　4.溫度低的時候，因流動相黏度增加而使檢測時間延長，同時增加
　　
　　泵的磨損，影響設備的使用壽命。
　　
　　5.溫度低的時候還因溶解度相對下降而出現緩沖鹽結晶而堵塞泵、
　　
　　進樣閥、管道、色譜柱的現象。
　　
　　6.溫度低時還因溶解度下降使雜質吸附在填料上而難于洗脫，從而
　　
　　影響色譜柱的使用壽命。
　　
　　.對于流動相溫度的控制目前沒有很好的方法，即使是整個室內使用空調也難于使流動相的溫度保持一致，因此，目前大多采用控制柱溫的方法，使用柱溫箱能耗低，控溫精度高，是液相色譜儀*的輔助設備，藥品標準中，有不少品種對柱溫也有明確要求。